Pensa-se que no lugar onde hoje existe esta igreja terá nascido e vivido durante algum tempo S. António. Ele é o santo padroeiro de Lisboa, e também conhecido como o santo de Pádua.
A igreja é de origem barroca, um templo de uma nave apenas e dois altares, tendo sido elevada à categoria de património nacional.
Foi parcialmente destruída pelo terramoto de 1755, e a sua reconstrução começou 12 anos depois, com a demolição da capela principal que tinha ficado em pé, assim como a recuperação da cripta, que dizem ter sido o local de nascimento do Santo.

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